Beldar (Dan Aykroyd) et Prymaat (Jane Curtin) sont des émissaires de la planète Remulak venus pour conquérir la Terre. Une mauvaise manœuvre plonge leur navette dans l’East River, près de New York. Vites repérés, ils sont poursuivis par les agents de la sécurité nationale. Vivre comme un “petit crâne” dans la banlieue est leur stratagème pour survivre : un petit pavillon, un petit boulot et bientôt un petit… cône !
En 2257, le commandant Sinclair et les officiels de Babylon 5 s'apprêtent à accueillir l'ambassadeur Kosh du puissant et mystérieux Empire Vorlon. Mais à peine celui-ci est-il arrivé sur la station, qu'il est victime une tentative d'assassinat : au Medlab, le docteur Kyle ne peut rien faire étant donné que Kosh est enfermé dans une sorte de carapace protectrice et que l'Empire Vorlon refuse catégoriquement qu'elle soit ouverte. Mais Sinclair passe outre les ordres des Vorlons afin de sauver Kosh : le docteur Kyle ouvre en partie sa combinaison et Lyta Alexander, la télépathe commerciale de la station, le scanne dans le but de découvrir ce qui s'est passé.
Après avoir échappé à une terrible tempête, l’équipage d’un navire de commerce découvre en plein océan un immense vaisseau scientifique russe… Une entité extraterrestre s’est introduite sur le vaisseau et a exterminé tout l’équipage. Commence alors une angoissante lutte à mort contre cette force terrifiante venue de l’espace…
Planète Terre, futur indéterminé. Choisi à la naissance pour ses qualités physiques et intellectuels, un humain devient, à force d'entraînement, le prototype du soldat apte à protéger la société. Mais la génération dont est issu le soldat (le sergent Todd) est bientôt remplacée par une nouvelle. Todd ne se résigne pas à disparaître et organise la résistance contre ces soldats d'un nouveau genre qui menacent l'équilibre même de la planète.
2047 : Le vaisseau spatial "Lewis & Clark" s’apprête à regagner sa base quand l'équipage reçoit l'ordre de gagner la station Daylight pour embarquer le physicien William Weir, avec lequel il doit repartir en direction de Neptune. Quelques années plus tôt, Weir avait conçu un engin spatial révolutionnaire capable de se déplacer plus vite que la lumière mais qui disparut corps et biens aux abords de Neptune. La mission du "Lewis & Clark" consiste à repérer l’épave de l'"Event Horizon", à déceler les causes de sa mystérieuse avarie et à récupérer les éventuels survivants.
Exceptional Vista, paisible bourgade d'Amerique du Nord, coule des jours paisibles, en depit de la fermeture de l'usine a ecrous. Mais voici qu'un beau jour le signal du relais de television se brouille et c'est la ville entiere qui bascule dans l'inconnu et la terreur: des citoyens disparaissent les uns apres les autres et leurs restes atrocement mutiles sont decouverts peu apres. L'arrivee d'un savant atomiste contribue a laisser croire que des extraterrestres ont debarque.
Une gigantesque météorite s'écrase quelque part dans le désert de l'Arizona, apportant avec elle les germes d'une vie extraterrestre protéiforme. Un certain Ira Kane, accompagné de son meilleur ami, Harry Block, tentent de protéger cette découverte des ambitions de l'armée, vite alertée. Ils se heurtent à Allison Reed, épidémiologiste gouvernementale qui entend bien les écarter des lieux. Mais au final, tous devront s'unir pour combattre les nouvelles et étranges formes de vie qui se reproduisent rapidement...
Un mois après qu’une faille a déchiré l'univers, l’équipe de Planet Express doit trouver un moyen d’y remédier. Mais c'est alors qu'ils découvrent que cette faille n’est autre qu’un passage vers un autre univers où vit une créature gigantesque et tentaculaire du nom de Yivo. Rapidement, la créature envahit la Terre et prend le contrôle de ses habitants avant de faire de Fry, le messie d’une nouvelle religion, dans le but de guider les humains vers un pseudo-paradis situé dans un autre univers, laissant les robots pour seuls héritiers de la Terre.